La Secretaría General de la Universidad organiza directamente los dos procesos electorales más importantes, tanto por el número de sectores como el número de votantes que participan, como son los de la elección de Rector y la elección de representantes en el Claustro. Además, existen otros procesos electorales, en los que la Secretaría General interviene en su inicio y apoyando en la resolución de cualquier consulta, problema o necesidad de material o documentación a lo largo de su desarrollo: son los de las elecciones de representantes para las Juntas de Facultad o Escuela y las de Decanos o Decanas y Directores o Directoras de Facultades y Escuelas.

Para facilitar el desarrollo de estos procesos electorales, el equipo de trabajo de Secretaría General que se encarga de las elecciones a Rector y las del Claustro, aportando sus conocimientos y experiencia, ha elaborado un Manual de Procedimiento Electoral para facilitar a las Facultades y Escuelas todas las tareas exigidas durante el desarrollo completo de los procesos electorales, desde la elaboración del calendario hasta la proclamación de los candidatos electos.