Las principales líneas estratégicas del IUED son:

1. Gestión: agilizar procesos de trabajo, establecimiento de prioridades, optimización de la gestión de los cursos, impulso a la imagen institucional y colaboración en proyectos. 
2. Formación: publicación de un programa de formación inicial y continua destinado al personal docente e investigador y al profesorado tutor, generación de guías técnicas y análisis de la efectividad de los cursos.
3. Innovación: reforzar y actualizar los grupos, jornadas y proyectos de innovación. Creación de un laboratorio de innovación y análisis de la efectividad de las propuestas.
4. Investigación institucional: generación de investigaciones relacionadas con las distintas necesidades de la institución que incluya aspectos como el análisis de los modelos metodológicos, el abandono, rendimiento en los nuevos entornos digitales de aprendizaje, etc.
5. Asesoramiento y orientación: asesoramiento a través de expertos en distintas áreas de conocimiento y formación impartida, así como orientación y evaluación del diseño de materiales básicos sobre la base de la metodología a distancia propia de la UNED.