Software
     
Programas relacionados con Química y la Enseñanza

Sitios Webs dónde conseguir o localizar programas de especial interés para la Química y la Enseñanza. Además se incluyen algunas direcciones Web dónde se encontrarán recopilaciones de programas de interés o enlaces a las páginas dónde poder conseguirlos.
   
Dibujo y visualización de estructuras moleculares

ChemSketch
http://www.acdlabs.com/download/chemsk.html

Programa freeware de dibujo de estructuras químicas de ACD, para Windows. Existen manuales de ChemSketch en la Web, realizados por los usuarios,  que nos ofrecen instrucciones y consejos para sacar un máximo rendimiento del programa, encuéntralos en:
http://www.acdlabs.com/educators/tutorials.html 


La misma empresa nos ofrece otras utilidades freeware:
http://www.acdlabs.com/download/


     
Chime
http://www.mdlchime.com/chime/

Conector (plug-in) realizado por MDL Information Systems, Inc., tanto para Internet Explorer como para Netscape.

Este programa nos resultará imprescindible para acceder a muchos de los recursos sobre química que encontramos en Internet. Se trata de un programa gratuito que nos permite visualizar moléculas 2D y 3D directamente en páginas Web.  Las moléculas no aparecerán como simples imágenes, sino que se puede interaccionar con ellas:  rotar, mover ... y guardarlas en diferentes formatos para utilizarlas con otros programas. 
Chime es una herramienta muy potente que puede ser programado mediante scripts para hacer cosas complejas, pero también puede ser utilizado a otros niveles de forma muy sencilla:

. Simplemente instalando el conector, el
  usuario podrá interaccionar con
  estructuras 3D que estén incluidas en
  páginas Web, tal y como
  mencionábamos arriba.

. Chime también nos permitirá la
  creación de páginas web que incluyan
  estructuras *.pdb. Esto requiere
  instrucciones sencillas en HTML y algún
  pequeño cambio en el servidor local
  que nos da servicio. 

Un buen sitio para empezar a conocer Chime es la guía para principiantes de Liz Dorland (Beginner's Guide to Chime). 

Para obtener más información y enlaces sobre Chime (incluyendo enlaces a estructuras moleculares) es recomendable visitar la página de  Eric Marz (U. Mass - Amherst): http://www.umass.edu/microbio/chime/




   
ISIS/Draw
http://www.mdli.com/downloads/isis.draw/
          isisdrawreg.html


Programa de dibujo de estructuras químicas de  MDL Information Systems, de libre distribución para utilización académica y personal. Disponible para Windows y Mac. 

MDL nos ofrece otros programas freeware que pueden ser de utilidad. Los localizaremos en:
http://www.mdli.com/downloads/free.html
De los programas que aquí se ofrecen podemos destacar:

. Chime: conector para visualizar moléculas en las
  páginas Web. 

. AutoNom Standard Add-in for ISIS/Draw and
  ISIS/Base
AutoNom (Automatic Nomenclature)
  genera nombres químicos de acuerdo con la IUPAC
  directamente desde las estructuras gráficas creadas
  en ISIS/Draw o registradas en ISIS/Base (base de
  datos para la gestión de estructuras químicas y datos
  asociados). 

 




    
Protein Explorer
http://molvis.sdsc.edu/protexpl/


Visualizador de macromoléculas, derivado de RasMol y Chime. Autor: Eric Martz.
Traducido al español por el profesor Gabriel Pons, de la Universidad de Barcelona (España):

http://www2.uah.es/biomodel/pe/inicio.htm

 
Rasmol
http://www.umass.edu/microbio/rasmol/index2.htm



Programa gratuito para la visualización de proteínas, ácidos nucleicos y pequeñas moléculas. Desarrollado en la Universidad de Edinburgo -Biocomputing Research Unit- y en el Departamento de Estructura Biomolecular de Glaxo I+D -Greenford, UK. 
Autor: Roger A. Sayle, Ph.D.

  
Creación para la Web
Hot Potatoes
http://web.uvic.ca/hrd/hotpot/ 

Conjunto de 6 aplicaciones desarrolladas por Half-Baked, que permiten crear ejercicios para para la Web (documentos HTML o DHTML) de forma muy sencilla. Los ejercicios que se pueden desarrollar son del tipo:

. respuesta múltiple elección
. respuesta corta
. emparejamiento
. crucigramas
. rellenar huecos
. ordenar palabras o letras

Es un programa de uso gratuito para usuarios en el área de educación, con la condición de que el material que se desarrolle con él sea puesto a la disposición de todo el mundo en la Web. 
El programa ofrece la posibilidad de configurar el interfaz para trabajar en castellano. Realmente sencillo de usar, y los resultados son impresionantes... Muy recomendable.

Además podemos encontrar los manuales también en castellano, traducidos por  Ismail Ali Gago, Profesor de Enseñanza Secundaria de Biología e Informática, en la siguiente dirección:
http://platea.pntic.mec.es/~iali/CN/Hot_Potatoes/
          intro.htm


     
Quandary
http://www.halfbakedsoftware.com/quandary/

Aplicación también de Half-Baked (creadores de Hot Potatores) para realizar lo que los autores denominan "laberintos interactivos para la Web (Web-based Action Mazes). Son preguntas con múltiple respuesta que se desarrollan en función de la respuesta seleccionada. Existen algunos ejemplos en la Web que nos ayudarán a conocer mejor las posibilidades de este tipo de actividades. Al igual que Hot Potatoes es realmente sencillo de utilizar, y los resultados son también muy buenos.

    
Varios
Chemware
http://chemware.co.nz/


Chemware es una empresa dedicada al desarrollo de "CHEMistry softWARE" de tipo educativo para estudiantes y profesores de Secundaria y Universidad. En su web incluye una sección en la que se recopilan programas shareware y freeware, a la que es muy interesante echar un vistazo:
http://chemware.co.nz/links.htm#shareware 


    
MestRe-C
http://qobrue.usc.es/jsgroup/MestRe-C/MestRe-C.htm
l

Conjunto de programas
gratuitos diseñados para el procesamiento, visualización y simulación de espectros y FIDs de RMN 1D y  2D (para Windows 95/98/NT/2000).
Desarrollado en la Universidad de Santiago de Compostela por MestRe Team ( F. Javier Sardina, Jacobo Cruces y Carlos Cobas) 
        
   
Chiminet
http://personal5.iddeo.es/pefeco/softeducativo.html

Sección dedicada a los programas de carácter educativo, para la enseñanza de la Química, clasificados y valorados por el autor, Pedro Fernández Cortés,dentro de la su mencionada web Chiminet. En la misma web encontramos otras secciones en las que:
. se relacionan enlaces a páginas Web donde se
  podrá obtener software directamente:

 
http://personal5.iddeo.es/pefeco/softhttp.html
. sitios FTP dónde localizar software químico:
  http://personal5.iddeo.es/pefeco/softftp.html
. otros software: "sitios seleccionados con software
  no químico y recursos para websmasters":
  http://personal5.iddeo.es/pefeco/otrosoft.html

En otra Web del mismo autor nos ofrece una recopilación de los "20 mejores programas para la docencia en ESO y Bachillerato": http://www.edu.aytolacoruna.es/aula/quimica/
         software/softw.htm

Estos programas están clasificados, según explica el autor, en los siguientes tipos:

. Modelización molecular: Programas para crear
  y visualizar moléculas en 3D.
. Diseño molecular: Programas para dibujar
  moléculas en 2D
. Cálculos estequiométricos: Programas para 
  realizar dichos cálculos
. Laboratorio: Programas simuladores de experiencias
. Tablas periódicas: Tablas periódicas en el ordenador
. Programas educativos: Programas específicos de
  enseñanza de Química
. Unidades y calculadoras: Conversores de unidades
  y calculadoras
. Otro software interesante: Utilidades específicas
  para Química



   
Rolf Claessen's Chemistry Index-Software
http://www.claessen.net/chemistry/soft_en.html

Recopilación de información y enlaces a programas relacionados con química, todos ellos clasificados en diferentes categorías: 

. Integrated Solutions
. Structure Drawing
. Modeling
. Visualization
. Spectroscopy
. Crystallography
. WWW Applications
. Databases
. Education
. Property and Activity Prediction
. Chromatography
. Other Chemistry Software
. Mathematics
. Other Software

En cada una de las categorías hay una sección dedicada a los programas freeware/shareware.
© Mercedes de la Fuente - UNED